L'eau se charge en substances organiques provenant entre autres des excréments des poissons, des débris de plantes et de reste de nourriture.
Pendant leur processus de dégradation biologique, les substances contenues dans l'eau peuvent produire des composants azotés nuisibles.
Au premier stade de la décomposition, apparaît l'ammoniac toxique ou l'ammonium non toxique. Au cours de cette phase, l'indice pH revêt une importance particulière.
Tant que l'indice pH reste inférieur à 7, il se forme de l'ammonium inoffensif, mais si l'indice pH dépasse 7,5, il se produit de l'ammoniac nocif pour les poissons.
Lors de la deuxième phase de décomposition de l'azote, certaines bactéries présentes dans l'aquarium transforment l'ammoniac en nitrite. Le nitrite est nocif et très dangereux pour les poissons. La teneur en nitrite ne devrait pas dépasser 0.8 mg/l.
Le 9 juillet 2006 : nitrites = 0,8 mg/l.

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